在COMSOL中模拟器官发生:模拟分支形态发生方法的比较
定量方法
2017-10-10 v1
摘要
在器官发生过程中,组织生长并变形。生长过程由可扩散的蛋白质(即所谓的形态发生素)控制。已经提出了许多不同的模式形成机制。肺发育过程中的定型分支程序可以通过基于受体-配体的图灵模型来重现。我们课题组先前使用任意拉格朗日-欧拉(ALE)框架在生长的肺域上求解受体-配体图灵模型。然而,肺生长过程中发生的复杂网格变形严重限制了可模拟的分支代数。一种新的相场实现通过将建模域的表面视为相之间的界面,并将反应-扩散框架耦合到这些表面,从而避免了网格变形。在本文中,我们对相场方法和基于ALE的模拟进行了严格的比较。
引用
@article{arxiv.1710.02876,
title = {Simulating Organogenesis in COMSOL: Comparison Of Methods For Simulating Branching Morphogenesis},
author = {Lucas D. Wittwer and Michael Peters and Sebastian Aland and Dagmar Iber},
journal= {arXiv preprint arXiv:1710.02876},
year = {2017}
}