在 COMSOL 中模拟器官发生：基于图像的建模
计算工程、金融与科学
2014-08-08 v1 组织与器官
摘要
数学建模在发育生物学中有着悠久的历史。实验技术和计算算法的进步使得开发越来越真实的器官发生模型成为可能。特别是，发育中器官的三维几何结构最近已可获取。本文展示了如何利用基于图像的数据在 COMSOL Multiphysics 中进行器官发生模拟。作为示例，我们使用了小鼠发育生物学中的经典模型系统——肢芽发育。我们讨论了如何利用 Matlab LiveLink 将包含多个子域的胚胎几何结构读入 COMSOL，以及如何利用这些结构在生长的胚胎域上模拟模型。ALE 方法被用于求解即使在强烈变形域上的信号传导模型。
引用
@article{arxiv.1408.1589,
title = {Simulating Organogenesis in COMSOL: Image-based Modeling},
author = {Zahra Karimaddini and Erkan Unal and Denis Menshykau and Dagmar Iber},
journal= {arXiv preprint arXiv:1408.1589},
year = {2014}
}