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亚细胞Min振荡中MinE环的自组织

亚细胞过程 2009-06-10 v1

摘要

我们对杆状细菌{\it 大肠杆菌}内蛋白质MinD和MinE亚细胞振荡过程中观察到的MinE环的自组织进行了建模。通过稳态近似,我们可以独立于Min振荡的其他细节,一般性地研究MinE环。MinE与正在解聚的MinD丝尖端的再结合,通过一个标度化的细胞形状参数r~\tilde{r}控制着MinE环的形成。我们在丝尖端附近发现了两种类型的E环轮廓:由沿细菌长度的一维MinE扩散控制的强平台型E环,或由丝尖端附近三维扩散控制的弱尖点型E环。虽然强E环的宽度取决于r~\tilde{r},但MinD丝尖端处MinE的占据分数是饱和的,因此解聚速度对r~\tilde{r}的依赖性不强。相反,对于弱E环,r~\tilde{r}和MinE与MinD的化学计量比都强烈控制着尖端占据,从而控制解聚速度。体内MinE环接近弱环与强环之间的阈值,因此MinD丝解聚速度应对细胞形状、化学计量比和MinE再结合速率敏感。我们还发现,在用于体外ATP酶活性测定的适当开放几何结构中,MinE环形成的瞬态过程相当长,这解释了在这些测定中观察到的较小MinE浓度下ATP酶活性的长时间延迟,而无需援引协同MinE活性。

关键词

引用

@article{arxiv.0906.1750,
  title  = {Self-organization of the MinE ring in subcellular Min oscillations},
  author = {Julien Derr and Jason T. Hopper and Anirban Sain and Andrew D. Rutenberg},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0906.1750},
  year   = {2009}
}

备注

8 pages, 5 figures