短DNA双链体的自组装：通过理论链接从粗粒化模型到实验
软凝聚态物质
2012-07-17 v1
摘要
短平末端DNA双链体（包含6到20个碱基对）由于末端碱基对之间的疏水堆积相互作用而自组装成多分散的半柔性链。在依赖于温度和双链体长度的临界浓度以上，这样的链会排列成液晶相。在这里，我们通过数值和理论相结合的方法研究这种双螺旋双链体的自组装。我们使用最近由Ouldridge等人提出的粗粒化DNA模型模拟体系统。然后我们直接从DNA模型评估理论框架的输入量。由此产生的无参数理论预测提供了各向同性相中模拟结果的准确描述。此外，理论上的各向同性-向列相边界与实验结果一致，提供了一种估计堆积自由能的途径。
引用
@article{arxiv.1204.0985,
title = {Self-assembly of short DNA duplexes: from a coarse-grained model to experiments through a theoretical link},
author = {Cristiano De Michele and Lorenzo Rovigatti and Tommaso Bellini and Francesco Sciortino},
journal= {arXiv preprint arXiv:1204.0985},
year = {2012}
}
备注
13 pages, 10 figures