通过循环相分离筛选前生物寡核苷酸
化学物理
2022-09-23 v1
摘要
早期地球上功能性寡核苷酸的出现需要一种分子选择机制来筛选具有前生物功能的特定序列。诸如每日温度振荡之类的循环过程在该环境中无处不在，并可能触发寡核苷酸相分离。在此，我们提出基于相分离循环的选择，该循环通过沉降在受寡核苷酸给料系统中实现。利用理论和 DNA 实验，我们展示了沉积致密相中的序列特异性富集，尤其是短22-mer DNA序列。其底层机制选择互补性，因为它富集那些在凝聚相中通过碱基配对紧密相互作用的序列。我们的机制还使初始弱偏倚的库能够随着循环推进增强其序列偏倚或替换最丰富的序列。我们的发现提供了一种选择机制的实例，该机制可能曾缓解了针对首批自催化自复制寡核苷酸的筛选。
引用
@article{arxiv.2209.10672,
title = {Selection of prebiotic oligonucleotides by cyclic phase separation},
author = {Giacomo Bartolucci and Adriana Calaça Serrão and Philipp Schwintek and Alexandra Kühnlein and Yash Rana and Philipp Janto and Dorothea Hofer and Christof B. Mast and Dieter Braun and Christoph A. Weber},
journal= {arXiv preprint arXiv:2209.10672},
year = {2022}
}