以近乎分子力学代价实现量子力学精度的溶液中分子构象采样
计算物理
2017-04-21 v1
摘要
我们引入一种方法来评估溶液中分子物种不同构象的相对布居，旨在达到量子力学精度，同时将计算代价保持在近乎分子力学水平。该目标通过结合长经典分子动力学模拟以采样系统自由能景观、先进聚类技术以识别最相关构象、以及热力学微扰理论以利用密度泛函理论的量子力学能量修正所得布居来实现。提出了一种用于评估由此达到的精度的定量准则。所得方法在水溶液中花青素（矢车菊素-3-葡萄糖苷）的具体案例中进行了演示。
引用
@article{arxiv.1704.06144,
title = {Sampling molecular conformers in solution with quantum mechanical accuracy at a nearly molecular mechanics cost},
author = {Marta Rosa and Marco Micciarelli and Alessandro Laio and Stefano Baroni},
journal= {arXiv preprint arXiv:1704.06144},
year = {2017}
}
备注
2 figures