ROMEO：用于生物分子结构与运动建模的机器人启发式算法即插即用软件平台
生物大分子
2019-05-22 v1 人机交互
摘要
动机：由于蛋白质结构在分子识别中的核心作用，大量计算工作致力于建模介导结构重排的蛋白质结构与运动。蛋白质结构空间的大小、维度与非线性带来了突出挑战。此类挑战亦出现于机器人运动规划中，且受机器人启发的蛋白质结构与运动处理正日益展现出高探索能力。受这些发现鼓舞，我们在此推出 ROMEO，即 Robotics prOtein Motion ExplOration（机器人蛋白质运动探索）框架。ROMEO 是一个开源、面向对象的平台，使研究者能够获取并复现已发表的受机器人启发的蛋白质结构与运动建模算法，并借助其即插即用架构促进新算法设计。可用性与实现：ROMEO 以 C++ 编写，发布于 GitLab（https://github.com/）。该软件基于知识共享许可协议（署名与非商业）自由可用。联系：[email protected]
引用
@article{arxiv.1905.08331,
title = {ROMEO: A Plug-and-play Software Platform of Robotics-inspired Algorithms for Modeling Biomolecular Structures and Motions},
author = {Kevin Molloy and Erion Plaku and Amarda Shehu},
journal= {arXiv preprint arXiv:1905.08331},
year = {2019}
}
备注
6 pages, 5 figures