衣壳粒动态供应在病毒衣壳自组装中的作用
亚细胞过程
2015-02-03 v1 生物物理
生物大分子
摘要
许多病毒依赖其衣壳的自组装来保护和运输基因组物质。对于许多病毒系统,特别是导致持续性感染的人类病毒(如乙型肝炎病毒、腺病毒或人类免疫缺陷病毒),衣壳粒在宿主细胞质中持续产生,而组装完成的衣壳则离开细胞进行新一轮感染。在此,我们利用通用斑点半粒子模型的粗粒化布朗动力学模拟,阐明了衣壳粒的动态供应对空 T1 二十面体病毒衣壳可逆自组装的作用。我们发现,在高衣壳粒流入速率下,仅存在一个狭窄的键强范围,使得连续衣壳生产的稳态成为可能。对于小于和大于该最优值的键强,反应体积分别会被小型和大型中间体所拥挤。对于较低的衣壳粒流入速率,存在更宽的键强范围可建立连续衣壳生产的稳态,尽管此时衣壳的生产速率较低。因此,我们的模拟表明,动态衣壳粒流入的细胞环境可以降低体外条件下典型的病毒衣壳组装对最优键强的依赖性。
引用
@article{arxiv.1502.00155,
title = {Role of dynamic capsomere supply for viral capsid self-assembly},
author = {Marvin A. Boettcher and Heinrich C. R. Klein and Ulrich S. Schwarz},
journal= {arXiv preprint arXiv:1502.00155},
year = {2015}
}
备注
Revtex, 26 pages, 7 EPS figures