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用于虚拟筛选的ROCS衍生特征

机器学习 2016-09-13 v3

摘要

化学结构快速叠加(ROCS)是一种用于计算三维形状和化学(“颜色”)相似度的标准工具。ROCS使用未加权和来结合相似度的多个方面,从而产生用于虚拟筛选的无参数模型。在本报告中,我们将ROCS颜色力场分解为“颜色分量”和“颜色原子重叠”,这是一种新颖的颜色相似度特征,可由机器学习算法以系统特定的方式进行加权。在交叉验证实验中,这些附加特征相对于标准ROCS显著改善了虚拟筛选性能(ROC AUC分数)。

关键词

引用

@article{arxiv.1606.01822,
  title  = {ROCS-Derived Features for Virtual Screening},
  author = {Steven Kearnes and Vijay Pande},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1606.01822},
  year   = {2016}
}

备注

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