大分子极化率张量的鲁棒且准确的计算估计
化学物理
2019-04-05 v1
摘要
通过电场使分子对齐可最小化取向平均，例如在单粒子成像实验中。分子对外加交流电场响应的规律由其极化率张量决定，该张量通常用量子化学方法计算。这些方法对大分子不可行。在此，我们使用一种回归模型计算蛋白质的极化率张量，该模型将20种氨基酸的极化率与相同形状的完美导体相关联。分子的介电常数可根据基于克劳修斯-莫索提（Clausius-Mossotti）方程的回归线斜率来估计。我们以Trp cage微型蛋白的量子化学结果及较大蛋白质的实测介电常数作为基准测试了我们的预测。我们的方法可应用于计算大分子的激光对齐，例如有益于单粒子成像，以及用于估计蛋白质和其他大分子的光学与静电特性。
引用
@article{arxiv.1904.02504,
title = {Robust and accurate computational estimation of the polarizability tensors of macromolecules},
author = {Muhamed Amin and Hebatallah Samy and Jochen Küpper},
journal= {arXiv preprint arXiv:1904.02504},
year = {2019}
}
备注
5 pages, 2 figures