重构谱系:一种随机视角
种群与进化
2007-06-19 v1
摘要
谱系是一个有向图,描述了有性繁殖种群中个体如何通过祖先相互关联。在本文中,我们探讨了是否可以通过仅观察现存个体的序列数据来重构谱系的问题。这一研究的动机源于基因组序列日益增加的可用性,但在本文中我们采取更理论化的方法,考虑什么样的序列演化模型可能允许谱系重构(给定足够长的序列)。我们的结果补充了最近的工作,该工作表明如果仅使用不同现存个体之间的亲缘度,谱系重构可能在根本上是不可能的。我们发现,对于某些随机过程,可以从足够长的序列中恢复出同构意义下的谱系。
引用
@article{arxiv.0706.2516,
title = {Reconstructing pedigrees: a stochastic perspective},
author = {Bhalchandra D. Thatte and Mike Steel},
journal= {arXiv preprint arXiv:0706.2516},
year = {2007}
}
评论
20 pages, 3 figures