通过并行路径交换计算反应速率
统计力学
2009-11-13 v1
摘要
路径采样模拟的效率可借助路径交换方法得到显著提升。为此,我们基于过渡界面采样技术设计了一种新的算法流程。沿用并行回火的思路,不同系综之间的路径被相互交换,但此处温度的角色由界面位置所取代。我们使用 Peyrard-Bishop-Dauxoux 模型,在 DNA 的变性转变上对该方法进行了测试。结果表明,新算法可将计算开销降低 20 倍。
引用
@article{arxiv.0704.3317,
title = {Reaction rate calculation by parallel path swapping},
author = {Titus S. van Erp},
journal= {arXiv preprint arXiv:0704.3317},
year = {2009}
}
评论
5 pages, 3 figures