通过射击点交换在广义系综中增强构型与路径空间的采样

许多分子过程的计算机模拟因长寿命态之间稀有跃迁引起的长时间尺度而变得复杂。在此，我们提出一种模拟此类稀有事件的新方法，该方法将过渡路径采样与构型空间的增强探索相结合。该方法依赖于基于广义系综在构型空间与轨迹空间之间进行交换移动。该方案显著提高了过渡路径采样模拟的效率，特别是对于具有多个过渡通道的系统，并在不扭曲分子过程动力学的情况下给出有关热力学、动力学和反应坐标的信息。该方法以KPTP四肽中脯氨酸的异构化为例加以说明。