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利用脉冲场使带电聚合物穿过对称纳米孔的棘轮输运:设计用于浓缩 DNA 的低通滤波器

软凝聚态物质 2023-01-31 v2 生物物理

摘要

我们提出一种结合纳米流体棘轮、纳米孔易位与脉冲场、按轮廓长度分离 DNA 分子的新概念。利用 Langevin 动力学模拟,我们表明可设计脉冲场序列对捕获的半柔性分子进行棘轮输运,使得仅短链成功易位,从而将纳米孔过程有效转化为低通分子滤波器。我们还表明非对称脉冲可显著提升器件效率。该过程本身可并行用于多个孔,并应可直接集成至纳米孔测序器件中,从而增加其潜在效用。

关键词

引用

@article{arxiv.2101.12712,
  title  = {Ratcheting charged polymers through symmetric nanopores using pulsed fields: Designing a low pass filter for concentrating DNA},
  author = {Le Qiao and Kai Szuttor and Christian Holm and Gary W. Slater},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2101.12712},
  year   = {2023}
}