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电子健康记录问答:数据集与模型的范围综述

机器学习 2023-11-09 v2 信息检索

摘要

基于患者相关数据的问答(QA)系统可辅助临床医生与患者。例如,它们可协助临床医生进行决策,并帮助患者更好地理解其病史。大量患者数据存储在电子健康记录(EHRs)中,使得 EHR QA 成为一个重要的研究领域。在 EHR QA 中,答案从患者的医疗记录中获取。由于数据格式与模态的差异,这与其他利用医学网站或科学论文检索答案的医学 QA 任务大不相同,使得研究 EHR 问答至关重要。本研究旨在对现有 EHR QA 工作进行方法学综述。我们在 Google Scholar、ACL Anthology、ACM Digital Library 和 PubMed 四个数字源中检索了 2005 年 1 月 1 日至 2023 年 9 月 30 日的文章,以收集 EHR QA 的相关出版物。我们确定了 4111 篇论文用于研究,在基于纳入标准筛选后,共获得 47 篇论文进行进一步研究。在这 47 篇中,25 篇关于 EHR QA 数据集,37 篇关于 EHR QA 模型。据观察,EHR 上的 QA 相对新颖且未被充分探索。大多数工作都较新。此外,观察到 emrQA 是迄今为止最流行的 EHR QA 数据集,无论在引用还是在其他论文中的使用方面。我们还识别了 EHR QA 中使用的不同模型及其评估指标。

关键词

引用

@article{arxiv.2310.08759,
  title  = {Question Answering for Electronic Health Records: A Scoping Review of datasets and models},
  author = {Jayetri Bardhan and Kirk Roberts and Daisy Zhe Wang},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2310.08759},
  year   = {2023}
}

备注

5 tables, 6 figures