相互作用基因型与独特型网络上的准种动力学：模型构建
种群与进化
2015-01-20 v1 统计力学
摘要
准种是一组相关基因型的稳态，这些基因型根据通常的选择和突变原理进行演化。准种研究 invariably 集中于基因型复制过程中出错的可能性及其在促进准种生存或消亡中的作用。在先前的工作 [V. C. Barbosa, R. Donangelo, and S. R. Souza, J. Theor. Biol. 312, 114 (2012)] 中，我们引入了一种基于单一概率参数 () 的准种动力学网络模型，能够解决先前模型的几个合理性问题。在此，我们将该模型扩展，将其网络与另一个旨在模拟免疫系统面对准种时动力学的网络配对。新网络基于免疫的独特型网络模型，与前一个网络共同构成了一个相互作用基因型与独特型的网络模型。所得模型需要更多参数，因此导致巨大的相空间。我们聚焦于一个特定的生态位，在其中可以观察到涉及准种生存或毁灭的权衡。在此生态位内，我们给出了模拟结果，突出了准种生存的一些关键先决条件。这些包括相对于独特型的基因型最小初始丰度以及 的最小值。特别是后者，与我们先前工作中独立的准种网络形成对比，在后者中任意低的 值构成了准种生存的保证。
引用
@article{arxiv.1311.4857,
title = {Quasispecies dynamics on a network of interacting genotypes and idiotypes: Formulation of the model},
author = {Valmir C. Barbosa and Raul Donangelo and Sergio R. Souza},
journal= {arXiv preprint arXiv:1311.4857},
year = {2015}
}