量子分子展开
量子物理
2021-07-30 v1
摘要
分子对接（MD）是药物发现过程中的重要步骤，旨在计算当两个分子相互结合时，其中一个分子相对于另一个分子的优选位置与形状。在此类分析中，分子的3D表示根据其自由度进行操作：刚性旋转平移以及沿可旋转键的片段转动。在我们的工作中，我们聚焦于分子对接过程的一个特定阶段，即分子展开（MU），其用于通过将被展开为展开形状来消除分子的初始偏置。MU问题的目标是找到使分子面积最大化，或等价地使分子内原子间内部距离最大化的构型。我们提出一种将MU表述为高阶无约束二值优化（HUBO）的量子退火方法，其可在最新的D-Wave退火硬件（2000Q与Advantage）上求解。将量子退火器获得的结果与性能同最先进的经典求解器进行比较。
引用
@article{arxiv.2107.13607,
title = {Quantum Molecular Unfolding},
author = {Kevin Mato and Riccardo Mengoni and Daniele Ottaviani and Gianluca Palermo},
journal= {arXiv preprint arXiv:2107.13607},
year = {2021}
}