量化生物系统中空穴转移耦合衰减的环境效应
化学物理
2014-05-06 v3 计算物理
摘要
在过去二十年中，全球许多研究小组试图理解和分类 DNA 等生物系统电荷转移中的简单机制。理论上讲，缺乏精确的电子 - 核动力学理论，以及模型哈密顿量和非绝热动力学所需参数（如耦合和位点能量）质量较差，是恰当描述电荷转移现象的两大主要困难。在本工作中，我们应用了一种先前经过基准测试且具有线性标度的子系统 DFT 方法，用于计算若干生物供体 - 受体二元体系以及由多达 5 个碱基对组成的双链 DNA 寡聚物的耦合、位点能量和超交换衰减因子 ()。所有计算均为全电子计算，清晰地展示了环境对 DNA 中超交换耦合的作用；计算结果遵循实验趋势并证实了先前的半经验计算。子系统 DFT 方法被证明是计算嵌入分子体系的长程、桥介导耦合及位点能量的优秀工具。
引用
@article{arxiv.1310.6189,
title = {Quantifying Environmental Effects on the Decay of Hole Transfer Couplings in Biosystems},
author = {Pablo Ramos and Michele Pavanello},
journal= {arXiv preprint arXiv:1310.6189},
year = {2014}
}