蛋白质功能影响包含 VNTR 的编码区频率及独特相互作用数量

已知由含有可变数目串联重复序列 (VNTR) 区域的基因编码的蛋白质在物种内具有多态性，但其不稳定性对分子相互作用的影响尚不清楚。VNTR 在特定功能组的编码序列中过量表达，其存在可能影响蛋白质相互作用。利用人类共识编码序列，本研究考察了由 VNTR 区域决定的基因组不稳定性是否影响蛋白质相互作用的数量。研究结果表明，就蛋白质功能而言，人类蛋白质中独特相互作用的频率随重复区域数量的增加而增加。这支持了重复序列扩增可能导致分子相互作用增加的实验证据。通过 $K_a/K_s$ 估算的遗传多样性似乎随着蛋白质 - 蛋白质相互作用数量的增加而降低。此外，G+C 和 CpG 含量与 VNTR 出现频率的增加呈负相关。这可能表明，核苷酸组成与选择过程共同作用可增加基因组稳定性，从而限制重复区域的扩增。参与乙酰化的蛋白质与大量的重复区域和相互作用相关，但 G+C 和 CpG 含量较低。相比之下，相互作用较少的膜蛋白包含较少数量的重复区域，但具有较高水平的 C+G 和 CpG。这项工作提供了进一步的证据，表明 VNTR 可能提供遗传变异性以产生蛋白质之间的独特相互作用。