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粗糙能量景观上的蛋白质折叠:分形网络上的构象扩散

软凝聚态物质 2015-05-13 v1 统计力学

摘要

我们利用模型蛋白质的模拟来研究粗糙能量景观上的折叠过程。我们构建了系统从未折叠态到天然态转变的“首通”网络。这些网络中的节点和键对应于能量景观中的盆地和它们之间的跃迁。我们发现折叠时间与节点数和键数之间存在幂律关系。我们表明,这些标度关系由首通网络的分形性质决定。在具有粗糙能量景观的系统中,可靠的折叠是可能的,因为首通网络具有小的分形维数。

关键词

引用

@article{arxiv.0906.4385,
  title  = {Protein folding on rugged energy landscapes: Conformational diffusion on fractal networks},
  author = {Gregg Lois and J. Blawzdziewicz and Corey S. O'Hern},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0906.4385},
  year   = {2015}
}

备注

4 pages, 6 figures