基于非平衡共进化过程预测蛋白质天然接触
生物大分子
2020-02-11 v1
摘要
分析同源蛋白质中残基的共进化是预测其天然构象的有力工具。共进化分析通常工作的标准框架是平衡 Potts 模型,假设蛋白质已进化足够长时间以在序列空间中达到热力学平衡。本文我们提出一种基于蛋白质进化动力学显式描述来刻画序列相关性的模型。我们表明,相较于基于平衡的模型,该过程提升了天然接触的正确预测率。
引用
@article{arxiv.2002.03383,
title = {Prediction of native contacts in proteins from an out--of--equilibrium coevolutionary process},
author = {D. Oriani and M. Cagiada and G. Tiana},
journal= {arXiv preprint arXiv:2002.03383},
year = {2020}
}