预测小 RNA 谱分析信号的稳定性
生物大分子
2024-03-20 v1
摘要
谱分析是通过从 Boltzmann 采样中提取信号来寻找不同 RNA 二级结构之间相似性的过程。谱分析的可重复性可以通过 Boltzmann 样本中特征数量的标准差来识别。我们发现了每个螺旋类的频率与其在重复 Boltzmann 采样下频率的标准差之间的强关系。我们开发了一种微扰技术来预测这些特征螺旋类的稳定性，而无需进行重复的 Boltzmann 采样，其准确率在 84% 到 94% 之间，具体取决于 RNA 的类型。与一次谱分析过程相比，我们的技术仅需 0.2% 的计算时间。
引用
@article{arxiv.2403.12827,
title = {Predicting the stability of profiling signals of small RNAs},
author = {Qiuyun Li and Manda Riehl},
journal= {arXiv preprint arXiv:2403.12827},
year = {2024}
}
备注
14 pages