基于无对齐方法的2019-nCoV系统发育研究（新型冠状病毒突变体的进化分叉）
基因组学
2022-01-31 v3
摘要
根据基因组序列的相似性重建SARS-CoV-2（nCov-19）病毒的系统发育树。Betacoronavirus的树拓扑结构与生物学家的分类系统高度一致。由于该树的构建包含了关于病毒突变体的足够信息，因此适用于研究在人类中传播的新型冠状病毒突变体之间的进化关系。研究了14类主要突变体的出现，这些毒株可归类为系统发育树的八个分叉。研究发现存在三种类型的病毒突变，即同一分支子分支间的突变、离根突变以及树的大分支之间的向根突变。从病毒突变与宿主选择关系的角度看，我们发现低免疫力个体为病毒进化的正向自然选择提供了特殊环境。这给出了一个机制来解释为什么在nCov-19系统发育树中两个远缘分支之间通常会发生大突变。该发现有助于制定控制COVID-19传播的策略。
引用
@article{arxiv.2003.01324,
title = {Phylogenetic Study of 2019-nCoV by Using Alignment Free Method (Evolutionary Bifurcation of Novel Coronavirus Mutants)},
author = {Yang Gao and Tao Li and Liaofu Luo},
journal= {arXiv preprint arXiv:2003.01324},
year = {2022}
}
备注
14 pages;2 figures