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用于测定生物分子一级结构的偏协方差二维质谱

化学物理 2019-04-15 v1 生物大分子

摘要

质谱(MS)广泛用于生物分子结构分析,并在蛋白质研究中占据主导地位。尽管其功能相当强大,但最先进的蛋白质质谱仍常常面临谱图到结构指派可靠性有限的问题。现代质谱仪器质量精度和分辨率的显著提高,或新碎裂方法的引入,均未能完全解决这一问题。在此,我们提出一种基于偏协方差映射的新型二维质谱,用于高保真测定生物分子一级结构。偏协方差二维质谱(pC-2DMS)可检测源自同一或连续分解事件的生物分子碎片之间的内在统计相关性。这使得能够识别在整个碎片质谱中,沿同一生物分子碎裂路径产生的离子对。我们证明,与标准一维质谱所依赖的单个碎片质荷比相比,pC-2DMS所揭示的碎片-碎片相关性提供了关于氨基酸序列及其共价修饰更为特异的信息。我们通过使用pC-2DMS解析标准质谱无法触及的组合修饰组蛋白肽的结构异构体,展示了其强大能力。

关键词

引用

@article{arxiv.1904.05946,
  title  = {Partial covariance two-dimensional mass spectrometry for determination of biomolecular primary structure},
  author = {Taran Driver and Ruth Ayers and Rüdiger Pipkorn and Bridgette Cooper and Nikhil Bachhawat and Serguei Patchkovskii and Vitali Averbukh and David R. Klug and Jon P. Marangos and Leszek J. Frasinski and Marina Edelson-Averbukh},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1904.05946},
  year   = {2019}
}