异步边界最小化问题的参数化复杂度
数据结构与算法
2015-03-30 v1
摘要
微阵列是用于基因发现以及疾病和癌症诊断的研究工具。与微阵列相关的两个突出但具有挑战性的问题是边界最小化问题（BMP）和给定放置的边界最小化问题（P-BMP）。本文研究了 BMP 和 P-BMP 在若干自然参数下的自然变体的参数化复杂度。我们证明 BMP 和 P-BMP 在以下两组参数下属于 FPT：1）字母表大小（c）、输入中序列的最大长度（l）和微阵列的行数（r）；以及 2）字母表大小和边界长度（o）。此外，当以 c 和 l 为参数时，P-BMP 属于 FPT。我们以相应的困难性结果补充了我们的可解性结果。
引用
@article{arxiv.1503.08078,
title = {Parameterized Complexity of Asynchronous Border Minimization},
author = {Robert Ganian and Martin Kronegger and Andreas Pfandler and Alexandru Popa},
journal= {arXiv preprint arXiv:1503.08078},
year = {2015}
}