用于生物分子构象研究的并行回火算法
化学物理
2009-10-30 v1 生物物理
计算物理
q-bio
摘要
研究了一种新算法——并行回火(parallel tempering)在生物分子数值模拟中的有效性。这些分子具有粗糙的能量地形。新方法克服了由此导致的数值模拟中的减速现象。通过对最简单的肽之一——甲硫氨酸脑啡肽(Met-enkephalin)进行高统计量的模拟证明了这一点。发现该新技术的数值有效性远优于传统方法,并可媲美广义系综技术(generalized ensemble techniques)等复杂方法。
引用
@article{arxiv.physics/9710041,
title = {Parallel Tempering Algorithm for Conformational Studies of Biological Molecules},
author = {Ulrich H. E. Hansmann},
journal= {arXiv preprint arXiv:physics/9710041},
year = {2009}
}
备注
Latex, ps-files included; to appear in Chem. Phys. Lett