字中间隙重复的最优搜索
形式语言与自动机理论
2015-10-05 v3
摘要
继 (Kolpakov et al., 2013; Gawrychowski and Manea, 2015) 之后,我们继续研究字符串中的 -间隙重复(-gapped repeats),其定义为因子 且满足 。我们的主要结果是:长度为 的字符串中极大 -间隙重复的数目具有 的界,而此前 (Kolpakov et al., 2013) 证明的界为 。对于密切相关的极大 -子重复(指数介于 与 之间的极大因子)概念,我们的结果意味着其数目具有 的界,这将 (Kolpakov et al., 2010) 的界改进了 因子。我们还证明了计算所有极大 -间隙重复的算法时间界为 ( 为输出规模)。受 (Gawrychowski and Manea, 2015) 启发,我们的解法不同于 (Tanimura et al., 2015) 最近发表的对同一界的证明。结合我们对 的界,这蕴含了一个计算所有极大 -间隙重复的 时间算法。
引用
@article{arxiv.1509.01221,
title = {Optimal searching of gapped repeats in a word},
author = {Maxime Crochemore and Roman Kolpakov and Gregory Kucherov},
journal= {arXiv preprint arXiv:1509.01221},
year = {2015}
}
备注
27 pages. arXiv admin note: text overlap with arXiv:1309.4055