第二信使信号中的最优频率:量化Pseudomonas aeruginosa中cAMP信息传输
生物物理
2024-08-12 v1 分子网络
摘要
细菌第二信使物质对于传递环境信息至细胞响应至关重要,但其信息传输容量的量化仍具有挑战。本文通过靶向基因敲除、光遗传学和荧光cAMP探针,在Pseudomonas aeruginosa中构建一个孤立的cAMP信使通路。该设计允许对cAMP动力学进行精确的光学控制和实时监测。通过将实验数据与信息论集成,我们揭示了光介导的cAMP信使信号的最优频率,可实现约40比特/小时的信息传输,该速率与cAMP降解动力学密切相关,并采用两种状态编码方案。我们的发现表明,通过时序编码第二信使信号可实现对多个基因的精细调控,为细菌适应性策略提供了新见解。该方法为量化细胞信使系统的信息处理提供了框架。
引用
@article{arxiv.2408.04988,
title = {Optimal Frequency in Second Messenger Signaling Quantifying cAMP Information Transmission in Bacteria},
author = {Jiarui Xiong and Liang Wang and Jialun Lin and Lei Ni and Rongrong Zhang and Shuai Yang and Yajia Huang and Jun Chu and Fan Jin},
journal= {arXiv preprint arXiv:2408.04988},
year = {2024}
}
备注
33 pages, 4 figures