关于有序列表子图嵌入问题
数据结构与算法
2014-03-11 v1
摘要
在（参数化的）有序列表子图嵌入问题（p-OLSE）中，给定两个图 和 ，每个图的顶点上都定义了线性序，一个函数 将 中的每个顶点关联到 中的一个顶点列表，以及一个参数 。问题是判断我们是否能将 中包含 个顶点的子图 （一对一地）嵌入到 中，使得：(1) 的每个顶点被映射到其关联列表中的一个顶点；(2) 及其在嵌入下映像所继承的线性序得到保持；(3) 如果 中的两个顶点之间存在边，则它们的映像之间也存在边。如果要求子图 作为导出子图嵌入，则得到有序列表导出子图嵌入问题（p-OLISE）。p-OLSE 和 p-OLISE 问题对生物信息学中与蛋白质结构比较/比对相关的各种问题进行了建模。我们研究了 p-OLSE 和 p-OLISE 关于以下结构参数的复杂性：函数 的宽度 （最大列表的大小），以及 的最大度 和 的最大度 。就所考虑的结构参数而言，我们在经典复杂性、参数化复杂性和近似计算的框架下，绘制了 p-OLSE 和 p-OLISE（及其优化版本）的完整复杂性全景。
引用
@article{arxiv.1403.2009,
title = {On the Ordered List Subgraph Embedding Problems},
author = {Olawale Hassan and Iyad Kanj and Daniel Lokshtanov and Ljubomir Perković},
journal= {arXiv preprint arXiv:1403.2009},
year = {2014}
}