粘弹性介质中驱动蛋白的运动
统计力学
2018-05-30 v1 生物物理
亚细胞过程
摘要
驱动蛋白是一种沿微管运输货物的分子马达。许多关于驱动蛋白-1 的体外实验结果由动力学模型描述，其中一次跃迁对应于拴系马达头的前向运动及随后的结合。我们认为，在像细胞胞质溶胶这样的粘弹性介质中，这一步骤不是马尔可夫的，必须用一个非指数等待时间分布来描述。我们为驱动蛋白引入了一个考虑此效应的半马尔可夫动力学模型。对于任意的等待时间分布，我们计算了所走步数的矩生成函数，并由此确定了马达的平均速度和扩散常数。我们以威布尔等待时间分布为例说明了我们的结果。我们发现，对于现实的参数值，粘弹性降低了速度和扩散常数，但增加了随机性（或法诺因子）。
引用
@article{arxiv.1710.07151,
title = {On the motion of kinesin in a viscoelastic medium},
author = {Gert Knoops and Carlo Vanderzande},
journal= {arXiv preprint arXiv:1710.07151},
year = {2018}
}