在粘弹性细胞质中运输货物的分子马达:如何以动力冲程克服亚扩散?
生物物理
2014-09-24 v1
摘要
大量实验已证明,活体生物细胞细胞质中较大示踪物(如信使 RNA 和内源性亚微米颗粒)的被动扩散异常缓慢,⟨δx²(t)⟩ ≃ t^α,其中 0 < α < 1,这被归因于细胞质的粘弹性物理本质。这一发现引出了一个问题:这种粘弹性环境在多大程度上影响主动的细胞内运输?自由亚微米货物(如囊泡和细胞器)的亚扩散是否总是意味着分子马达(如驱动蛋白)的运输异常缓慢,即定向运输的特征是平均距离的亚线性增长,⟨x(t)⟩ ≃ t^{α_eff},其中 0 < α_eff < 1?在此,我们研究一个通用模型方法,该方法结合了普遍接受的驱动蛋白马达的双态布朗棘轮模型,该模型基于由闪烁结合势驱动的沿微管的连续态扩散。马达弹性耦合到一个货物粒子上,而该粒子又受到粘弹性细胞质环境的影响。根据货物尺寸、负载力、结合势振幅和分子马达的转换频率等物理参数,运输既可以是正常的 (α_eff = 1),也可以是异常的 (α ≤ α_eff < 1)。我们特别详细地展示了,尽管货物粒子的被动扩散异常缓慢,高效的正常马达运输如何能够涌现,以及当参数改变时,同一马达在同一细胞中的主动运动如何可能变得异常缓慢。
引用
@article{arxiv.1312.5526,
title = {Molecular motors transporting cargos in viscoelastic cytosol: how to beat subdiffusion with a power stroke?},
author = {Igor Goychuk and Vasyl O. Kharchenko and Ralf Metzler},
journal= {arXiv preprint arXiv:1312.5526},
year = {2014}
}