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驱动蛋白是一种进化精细调控的、方向性锁定的分子棘轮-棘爪装置

生物物理 2015-05-13 v1

摘要

常规驱动蛋白是一种二聚体马达蛋白,负责将膜状细胞器向微管正端运输。单个驱动蛋白二聚体表现出坚定的方向性和数百个连续步进,然而其详细的物理机制仍不清楚。本文通过充分考虑分子细节,计算了所有可能相互作用构型下整个二聚体-微管系统的自由能。仅利用第一性原理和几个已测量的结合能及势垒能,系统级分析揭示了构型间不可逾越的能量间隙、由机械提升构型简并性引起的不对称基态,以及确保两个马达结构域交替催化协调的禁止跃迁。这些丰富的物理效应将驱动蛋白二聚体转化为一个分子棘轮-棘爪装置,该装置坚定地将二聚体的运动锁定在微管正端,并确保其以交替步态连续步进。然而,在一定范围的极端负载下,该棘轮-棘爪装置会出现缺陷但并未完全失效,从而允许连续的后退步。本研究提供了定量证据,表明驱动蛋白的多种分子特性已通过进化适应来精细调控该棘轮-棘爪装置,从而确保马达蛋白的卓越性能。

关键词

引用

@article{arxiv.0907.1726,
  title  = {Kinesin Is an Evolutionarily Fine-Tuned Molecular Ratchet-and-Pawl Device of Decisively Locked Direction},
  author = {Zhisong Wang and Min Feng and Wenwei Zheng and Dagong Fan},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0907.1726},
  year   = {2015}
}

备注

10 printed pages