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F-肌动蛋白中激发动力学:自动机模型

新兴技术 2017-05-29 v1

摘要

我们将丝状肌动蛋白分子表示为有限状态机图(F-肌动蛋白自动机)。图中的每个节点取三种状态——静息、激发、不应。所有节点在离散时间步中同步并按相同规则更新其状态。考虑了两种规则:阈值规则——如果一个静息节点至少有一个激发邻居,则它被激发;窄激发区间规则——如果一个静息节点恰好有一个激发邻居,则它被激发。我们分析了 F-肌动蛋白自动机演化中暂态周期和极限环长度的分布,提出了极限环形成的机制,并评估了 F-肌动蛋白自动机中的信息存储密度。

关键词

引用

@article{arxiv.1705.09402,
  title  = {On dynamics of excitation in F-actin: automaton model},
  author = {Andrew Adamatzky},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1705.09402},
  year   = {2017}
}