基于细胞核定位的多染色全切片图像点集配准

全切片图像（WSIs）为在细胞水平上研究组织结构提供了出色的细节。为了在各种蛋白质生物标志物和细胞亚型的背景下研究肿瘤微环境（TME），通常需要使用多染色 WSIs 进行特征分析和配准。多染色 WSI 图像对通常存在刚性和非刚性变形，此外还有切片伪影和控制组织，这给精确配准带来了挑战。传统的配准方法主要关注全局刚性/非刚性配准，但在细胞核水平上对齐具有复杂组织变形的切片时存在困难。然而，细胞核水平的非刚性配准对于下游任务（如在蛋白质生物标志物特征背景下进行细胞亚型分析）至关重要。本文专注于使用基于细胞核定位的点集配准方法进行局部水平的非刚性配准，以对齐多染色 WSIs。我们利用在不同染色中显著且（在很大程度上）一致的细胞核空间分布来建立空间对应关系。我们使用包含 54 张 H\&E 和 PHH3 图像对的重染色图像的 HYRECO 数据集来评估我们的方法。如果有良好的细胞核检测算法可用，该方法可以扩展到其他 IHC 和 IF 染色的 WSIs。该模型的性能针对现有的配准算法进行了测试，并表明在细胞核水平配准上优于该模型。