DeeperHistReg:稳健的全切片图像注册框架
图像与视频处理
2024-04-24 v1 计算机视觉与模式识别
定量方法
摘要
DeeperHistReg 是一个用于注册使用不同染色剂获取的全切片图像(WSIs)的软件框架。它允许进行预处理、初始对齐和使用不同染色剂(如 hematoxylin \& eosin、免疫化学)获取的 WSIs 的非刚性注册。该框架实现了几种最先进的注册算法,并提供了在任意分辨率(最高达 200k x 200k)上的操作接口。该框架可扩展,其他研究人员可以轻松集成新的算法。该框架以 PyPI 软件包和 Docker 容器的形式提供。
引用
@article{arxiv.2404.14434,
title = {DeeperHistReg: Robust Whole Slide Images Registration Framework},
author = {Marek Wodzinski and Niccolò Marini and Manfredo Atzori and Henning Müller},
journal= {arXiv preprint arXiv:2404.14434},
year = {2024}
}