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细胞核中表观基因组微相分离的非平衡理论

软凝聚态物质 2020-01-08 v1 生物物理 基因组学

摘要

理解基因组在细胞核中的空间组织是当前生物物理学中的重大挑战之一。沿基因组沉积的某些生化——或表观遗传——标记被认为在决定基因组组织和细胞身份中起着重要但鲜为人知的作用。表观遗传动态与基因组折叠之间相互作用的物理原理仍不清楚。在此我们提出并研究了一个假设表观遗传标记与基因组密度间存在耦合的理论,该理论可应用于整个细胞核的尺度。我们表明平衡模型与实验不相容,而通过考虑能够稳定微相分离表观基因组结构域的非平衡过程,可恢复定性一致。我们最后讨论了这些项的潜在生物物理起源。

关键词

引用

@article{arxiv.1910.14163,
  title  = {Nonequilibrium Theory of Epigenomic Microphase Separation in the Cell Nucleus},
  author = {Davide Michieletto and Davide Colí and Davide Marenduzzo and Enzo Orlandini},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1910.14163},
  year   = {2020}
}

备注

To appear in PRL; The quality of figures in this version is downgraded to comply with the arXiv storage limits