球-伸展转变的非平衡马尔可夫状态建模
软凝聚态物质
2017-02-28 v1 统计力学
摘要
我们描述了一种系统方法，从被驱动至非平衡稳态的系统的分子动力学数据构建粗粒化马尔可夫状态模型。我们将该方法应用于研究剪切流中单个拴系模型聚合物的球-伸展转变。粗粒化模型的折叠/解折叠速率与原始详细模型一致。我们证明折叠/解折叠通过构型空间中同一狭窄区域进行，但沿不同的循环路径。
引用
@article{arxiv.1611.02990,
title = {Non-Equilibrium Markov State Modeling of the Globule-Stretch Transition},
author = {Fabian Knoch and Thomas Speck},
journal= {arXiv preprint arXiv:1611.02990},
year = {2017}
}