最小基因组近乎完整的蛋白质结构建模
生物大分子
2020-07-15 v1
摘要
蛋白质三级结构预测在近年来取得了显著进展。多种蛋白质组中相当大一部分可在缺乏结构模板的情况下被建模。我们探究了我们的 DMPfold 方法能否对 JCVI-syn3.0 最小基因组（包含 438 个蛋白质）中所有无模板蛋白质进行建模。我们发现，除 10 个蛋白质外，其余均可提供有用的三级结构注释。这些模型可在功能未知时辅助注释功能，并为 29 个缺乏单体模型的预测蛋白质-蛋白质相互作用提供覆盖。我们还表明，DMPfold 在初始发表后释放结构的蛋白质上表现良好。最小基因组很可能在几年内实现完整的结构覆盖。
引用
@article{arxiv.2007.06623,
title = {Near-complete protein structural modelling of the minimal genome},
author = {Joe G Greener and Nikita Desai and Shaun M Kandathil and David T Jones},
journal= {arXiv preprint arXiv:2007.06623},
year = {2020}
}
备注
JGG and ND contributed equally to the work