微蛋白次级与三级结构预测的方法
生物大分子
2025-11-20 v1
摘要
微蛋白是新近被认识到且快速增长的小型蛋白质类别，通常由不足100至150个密码子编码，翻译自小型开放阅读框（smORFs）。尽管研究表明，smORFs及其对应的微蛋白构成了基因组和蛋白质组中的重要部分，但关于微蛋白结构特征的文献信息仍有限。本文我们讨论了用于预测其次级和三级结构的方法，并提供了使用三种典型方法（AlphaFold、I TASSER和ROSETTA）进行计算的示例。我们对44个微蛋白进行结构预测。对于这一微蛋白集合，所考虑的方法之间显示出合理的一致性，并与极少数可获得实验结构的案例一致。然而，与实验结构的一致性不如大型蛋白质，这表明需要获得更大比例的实验微蛋白结构，以更好地评估并最终校准预测方法。
引用
@article{arxiv.2511.15628,
title = {Methods for Secondary and Tertiary Structure Prediction of Microproteins},
author = {Julio C. Facelli},
journal= {arXiv preprint arXiv:2511.15628},
year = {2025}
}