量化 OpenFold 组件在蛋白质结构预测中的作用
生物大分子
2025-11-20 v1 人工智能
摘要
AlphaFold2 和 OpenFold 等模型已彻底变革了蛋白质结构预测，但其内部工作方式仍鲜有了解。我们提出了一种方法论，用于系统性评估单个 OpenFold 组件对结构预测精度的贡献。我们确定了几个对大多数蛋白质至关重要的组件，而另一些组件在不同蛋白质之间重要性不同。我们进一步展示了若干组件的贡献与蛋白质长度相关。这些发现提供了关于 OpenFold 如何实现准确预测的见解，并为更广泛地解释蛋白质预测网络指明了方向。
引用
@article{arxiv.2511.14781,
title = {Quantifying the Role of OpenFold Components in Protein Structure Prediction},
author = {Tyler L. Hayes and Giri P. Krishnan},
journal= {arXiv preprint arXiv:2511.14781},
year = {2025}
}
备注
Accepted to the NeurIPS 2025 Workshop on Multi-modal Foundation Models and Large Language Models for Life Sciences