肌球蛋白 V 跨越 Arp2/3 连接点：基于弹性杠杆臂模型计算的分支比
生物物理
2008-04-03 v1 软凝聚态物质
生物大分子
摘要
肌球蛋白 V (Myosin V) 是一种双头过程性马达蛋白，以“手递手”方式沿肌动蛋白丝行走。当遇到由 Arp2/3 复合物形成的丝状分支时，它既可以停留在直的母丝上，也可以切换到子丝上。我们利用肌球蛋白 V 的弹性杠杆臂模型研究了这两种概率。我们计算了所有相关构型的形状和弯曲能，这些构型中后头结合在 Arp2/3 之前的肌动蛋白丝上，而前头则结合在母丝或子丝上。基于头部结合到特定肌动蛋白亚基的概率与从弹性能获得的玻尔兹曼因子成正比的假设，我们计算了母丝与子丝的分支比。我们的模型预测子丝的比例为 27%，母丝为 73%。该结果与最近的实验数据吻合良好。
引用
@article{arxiv.0712.2324,
title = {Myosin V passing over Arp2/3 junctions: branching ratio calculated from the elastic lever arm model},
author = {Andrej Vilfan},
journal= {arXiv preprint arXiv:0712.2324},
year = {2008}
}
备注
9 pages, 7 figures, to appear in Biophysical Journal