核苷酸与靶蛋白之间的多相相互作用
生物物理
2016-08-29 v1 软凝聚态物质
生物大分子
摘要
核苷酸鸟苷四磷酸（ppGpp）和鸟苷五磷酸（pppGpp）与靶蛋白结合以促进细菌存活（Corrigan 等，2016）。因此，这些核苷酸与 GTPase RsgA 的结合会抑制 GTP 的水解。剂量响应曲线原本被认为相对于抑制剂浓度的对数呈曲线关系，但当将 6 个实验合并分析时，用多相模型表示要好得多（P<0.001），其各段直线具有高至极高的绝对 r 值，且相变以非连续性（跳跃）形式出现。放射性标记核苷酸与 GTP 合成酶 HprT 和 Gmk 的结合曲线，同样被认为相对于蛋白质浓度的对数呈曲线关系。然而，这些曲线用多相模型表示再次远优于曲线模型（在 ppGpp 和 pppGpp 与 HprT 结合的 8 个实验中，每个实验的 P 值范围从 0.047 到 <0.001）。GTP 与 HprT 的结合以及三种核苷酸与 Gmk 的结合，用曲线模型表示也很差，但用多相模型（直线，部分平行）表示则很好。
引用
@article{arxiv.1608.07459,
title = {Multiphasic interactions between nucleotides and target proteins},
author = {Per Nissen},
journal= {arXiv preprint arXiv:1608.07459},
year = {2016}
}