整合动态结构生物学揭示大型GTP酶寡聚化所必需构象体
生物物理
2024-02-28 v1 生物大分子
摘要
鸟苷酸结合蛋白（GBPs）是具有结构域的可溶性dynamin样蛋白，其结构域发生构象转变以实现GTP控制的寡聚化，从而作为哺乳动物细胞先天免疫系统的一部分发挥作用——通过破坏细胞内寄生虫的膜来攻击它们。该过程的结构基础与机制尚不清楚。因此，我们应用中子自旋回波、X射线散射、荧光和EPR光谱作为针对人GBP1（hGBP1）的整合动态结构生物学技术。我们通过子域的运动谱绘制了hGBP1从纳秒到毫秒的基本动力学。我们发现C端效应结构域在s时间尺度上具有不依赖GTP的柔性，并从结构上表征了hGBP1能像折刀一样打开以进行寡聚化所必需的构象体。这揭示了hGBP1的内在柔性、GTP触发的GTP酶结构域结合以及依赖于组装的GTP水解，作为控制其在极性组装中可逆寡聚化及随后凝聚体形成的功能设计原理。
引用
@article{arxiv.2004.04229,
title = {Integrative dynamic structural biology unveils conformers essential for the oligomerization of a large GTPase},
author = {Thomas-Otavio Peulen and Carola S. Hengstenberg and Ralf Biehl and Mykola Dimura and Charlotte Lorenz and Alessandro Valeri and Semra Ince and Tobias Vöpel and Bela Faragó and Holger Gohlke and Johann P. Klare and Andreas M. Stadler and Claus A. M. Seidel and Christian Herrmann},
journal= {arXiv preprint arXiv:2004.04229},
year = {2024}
}
备注
83 pages