基于多重投影的心血管疾病与抑郁症多层网络
计算工程、金融与科学
2024-08-27 v2
摘要
心血管疾病(CVD)与抑郁症表现出显著的共病关系,这对不良临床结局具有高度预测性。然而,潜在的生物学通路仍然难以解析,这可能是由于跨多种机制的非线性关联所致。在本研究中,我们提出了一种基于互信息相关性的多重投影方法,用于构建多层疾病网络,作为探索此类复杂关系的新方法。我们将该方法应用于青年芬兰研究(Young Finns Study)某一波次的横截面数据集,该数据集包含心血管疾病和抑郁症的数据,以及相关风险因素和两种组学生物标志物:代谢物和脂质。我们没有直接关联心血管疾病相关表型和抑郁症状,而是将二分网络的概念扩展为多重网络,将这些表型和症状与中间生物变量相连接。从这些中间变量进行投影得到一个加权多层网络,其中心血管疾病与抑郁症变量之间的每条链接都以其所属层(即代谢组或脂质组)进行标记。应用该投影方法,我们识别出可能连接心血管疾病与抑郁症的潜在中介生物标志物。因此,这些生物标志物可能在心血管疾病-抑郁症共病的生物学通路中发挥重要作用。此外,网络投影还突出了性别和BMI作为这种共病的关键风险因素或混杂因素。我们的方法可以扩展以纳入任意数量的组学层和多种疾病表型,从而提供对共病生物学通路的全面、系统级视角。
引用
@article{arxiv.2408.07562,
title = {Multilayer Network of Cardiovascular Diseases and Depression via Multipartite Projection},
author = {Jie Li and Cillian Hourican and Pashupati P. Mishra and Binisha H. Mishra and Mika Kähönen and Olli T. Raitakari and Reijo Laaksonen and Mika Ala-Korpela and Liisa Keltikangas-Järvinen and Markus Juonala and Terho Lehtimäki and Jos A. Bosch and Rick Quax},
journal= {arXiv preprint arXiv:2408.07562},
year = {2024}
}