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基于低层线索的多模态图像多流细胞分割

计算机视觉与模式识别 2023-10-24 v1

摘要

由于多模态显微图像中复杂的纹理、模式与细胞形状,其细胞分割仍具挑战性。为应对该问题,我们首先开发了一个自动细胞分类流程,基于低层图像特征对显微图像进行标注,随后依据类别标签训练一个分类模型。之后,我们使用对应类别的图像为每个类别分别训练一个分割模型。此外,我们进一步部署两类分割模型,分别分割圆形与不规则形状的细胞。同时,采用一个高效且强大的骨干模型来提升分割模型的效率。在 NeurIPS 2022 细胞分割挑战赛的 Tuning Set 上评估,我们的方法取得了 0.8795 的 F1 分数,且所有病例的运行时间均在时间容限之内。

关键词

引用

@article{arxiv.2310.14226,
  title  = {Multi-stream Cell Segmentation with Low-level Cues for Multi-modality Images},
  author = {Wei Lou and Xinyi Yu and Chenyu Liu and Xiang Wan and Guanbin Li and Siqi Liu and Haofeng Li},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2310.14226},
  year   = {2023}
}

备注

The second place in NeurIPS 2022 cell segmentation challenge (https://neurips22-cellseg.grand-challenge.org/), released code: https://github.com/lhaof/CellSeg