基于数据与物理双驱动生成框架的多目标荧光分子设计
机器学习
2026-01-21 v1 人工智能
化学物理
生物大分子
摘要
设计具有定制光学与物理化学性质的荧光小分子,需要在广阔且未充分探索的化学空间中导航,同时满足多重目标与约束。由于搜索效率低、机器学习预测的泛化性不可靠以及量子化学计算成本高昂,传统的“生成-评分-筛选”方法在此类现实设计规范下变得不切实际。在此,我们提出了 LUMOS,一个用于荧光分子逆向设计的数据与物理双驱动框架。LUMOS 将生成器与预测器耦合于共享的潜在表示中,实现了从设计规范直接到分子的设计及高效探索。此外,LUMOS 将神经网络与快速的含时密度泛函理论(TD-DFT)计算工作流相结合,构建了一套在速度、准确性与泛化性之间权衡互补的预测器,从而在多样场景下实现可靠的性质预测。最后,LUMOS 采用与多目标进化算法相结合的属性引导扩散模型,实现了多重目标与约束下的从头设计与分子优化。在综合基准测试中,LUMOS 在荧光性质预测的准确性、泛化性与物理合理性上始终优于基线模型,并在多目标骨架级与片段级分子优化中展现出卓越性能。使用 TD-DFT 与分子动力学(MD)模拟的进一步验证表明,LUMOS 能生成满足各种目标规范的有效荧光团。总体而言,这些结果确立了 LUMOS 作为通用荧光团逆向设计的数据与物理双驱动框架。
引用
@article{arxiv.2601.13564,
title = {Multi-objective fluorescent molecule design with a data-physics dual-driven generative framework},
author = {Yanheng Li and Zhichen Pu and Lijiang Yang and Zehao Zhou and Yi Qin Gao},
journal= {arXiv preprint arXiv:2601.13564},
year = {2026}
}
备注
Total 43 pages: 32 pages Main Text + 11 pages SI