盐杆菌（Halobacterium salinarum）对石盐 brine包裹体的分子适应
生物物理
2023-05-23 v1 等离子体物理
摘要
嗜盐微生物可在盐晶的brine包裹体内存活早已为人所知，含色素嗜盐菌的盐晶变色即为证据。然而，数十年来允许此种存活的分子机制一直悬而未决。尽管石盐（NaCl）表面灭菌方案已能从石盐brine包裹体内分离细胞与DNA，但基于“组学”的方法面临两主要技术挑战：（1）去除石盐表面所有污染性有机生物分子（含蛋白质）；（2）直接从石盐brine包裹体内细胞中选择性提取生物分子，且速度足够快以避免提取中基因表达改变。本研究测试不同方法以解决这两大技术挑战。方法开发后，我们将优化方法用于首次考察模型嗜盐古菌（Halobacterium salinarum NRC-1）对石盐brine包裹体的早期适应。对蒸发后两个月的盐杆菌细胞蛋白质组的考察揭示其与静止期液体培养高度相似，但核糖体蛋白急剧下调。尽管中心代谢蛋白为液体培养与石盐brine包裹体所共有蛋白质组的一部分，但细胞运动相关蛋白（古菌鞭毛、气胞）在石盐样品中缺失或丰度较低。brine包裹体内细胞特有蛋白包含转运蛋白，提示细胞与周围brine包裹体微环境间互作发生改变。本文方法与假设可赋能未来对培养模型与自然石盐系统中嗜盐菌存活的研究。
引用
@article{arxiv.2305.11904,
title = {Molecular acclimation of Halobacterium salinarum to halite brine inclusions},
author = {C. Favreau and A. Tribondeau and M. Marugan and F. Guyot and B. Alpha-Bazin and A. Marie and R. Puppo and T. Dufour and A. Huguet and S. Zirah and A. Kish},
journal= {arXiv preprint arXiv:2305.11904},
year = {2023}
}