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线粒体中ATP产生的建模

生物物理 2014-04-22 v2 分子网络

摘要

我们重新审视了最近由Bertram, Pedersen, Luciani和Sherman (BPLS)引入的线粒体中ATP产生的数学模型,该模型是对更完整但复杂的Magnus和Keizer模型的简化。我们发现了BPLS原始近似中两个通量率的不准确性,即腺嘌呤核苷酸转位酶速率J_ANT和钙单向转运体速率J_uni。我们为这些通量率引入了新的近似,然后分析了模型的一些动力学性质。通过详尽的数值探索,我们推断,对于生理上可接受的线粒体变量和呼吸输入范围,改进的BPLS方程具有唯一的吸引子不动点,正如稳态所预期的那样。我们确定了在稳态下,线粒体变量对呼吸输入的依赖性,即胞质钙浓度Ca_c和底物果糖1,6-二磷酸FBP。观察到与原始BPLS模型相同的钙和FBP饱和的动力学效应。然而,我们发现了一个新的非稳态效应,原则上可能具有生理意义:对于高浓度的钙和/或FBP,模型的一些响应时间趋于显著增加。特别是,Ca_c和/或FBP的浓度越大,达到稳态所需的时间越长。

关键词

引用

@article{arxiv.1212.1194,
  title  = {Modelling the ATP production in mitochondria},
  author = {Alberto Saa and Kellen M. Siqueira},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1212.1194},
  year   = {2014}
}

备注

16 pages, 6 figures. Final version to appear in the Bulletin of Mathematical Biology. Scilab codes available at http://vigo.ime.unicamp.br/atp/