具有多态性位点的基因组进化中的生存与等位基因互补建模

我们模拟了由二倍体基因组个体组成的有性繁殖种群的进化。一个由八个比特组成的序列形成一个等位基因，占据一个单倍体基因组（染色体）的128个位点之一。环境要求每个位点具有特定的活性，该活性是位于两条染色体上对应位点的两个等位基因的活性之和。该活性由设置为零的比特数表示。在恒定环境中，最适合的个体是纯合的，其等位基因活性对应于环境对位点要求的一半（在二倍体基因组中，对应位点的两个等位基因产生适当的活性）。在相对较低的重组率下改变环境，会促进更多多态性等位基因的产生。在杂合位点，不同活性的等位基因相互互补，以满足环境要求。然而，种群的基因库朝着数量非常有限的互补单倍型方向进化，而快速变化的环境会导致种群灭绝。如果模拟从所有位点均为杂合开始，它们将在很长一段时间内保持杂合状态。