基于模型的埃及丙型肝炎病毒突变率估计框架
人工智能
2013-03-22 v1
摘要
丙型肝炎病毒（HCV）是一种在世界范围内广泛传播的疾病。HCV具有非常高的突变率，使其对抗体产生耐药性。对HCV进行建模以识别病毒的突变过程，对于其检测和预测其进化至关重要。本文提出了一种基于模型的框架，分两步估计HCV的突变率。首先，构建剖面隐马尔可夫模型（PHMM）架构，以选择代表每年序列的序列。其次，使用序列间的成对距离方法计算突变率。在埃及HCV基因4型a亚型（HCV4a）数据集的NS5B区域上进行了初步研究。
引用
@article{arxiv.1303.5177,
title = {Model Based Framework for Estimating Mutation Rate of Hepatitis C Virus in Egypt},
author = {Nabila Shikoun and Mohamed El Nahas and Samar Kassim},
journal= {arXiv preprint arXiv:1303.5177},
year = {2013}
}
备注
6 pages, 5 figures